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Dal 1927, pochi anni dopo la sua fondazione, il Museo pubblica annualmente un volume scientifico, il Bollettino del Museo civico di Storia Naturale di Venezia, e altri volumi a finalità più divulgative con carattere non periodico (Supplementi e Quaderni).
L'indice delle pubblicazioni edite dal Museo fino al 1999, elencate in ordine alfabetico-cronologico per autori, è raccolto nel volume n. 6 dei Quaderni.
Sul Bollettino vengono pubblicati lavori inediti in italiano, inglese, francese, tedesco e spagnolo previa approvazione della redazione; i testi devono essere redatti secondo precise norme redazionali.
La pubblicazione di periodici scientifici ha molteplici scopi: illustrare le attività del Museo, il suo patrimonio scientifico e l'incremento delle collezioni; far conoscere l'attività di ricerca del personale scientifico e di quei privati ricercatori o associazioni che sempre gravitano attorno ad un museo e ne costituiscono il tessuto connettivo; diffondere guide e materiali didattici. Infine, allo scopo di favorire lo scambio di riviste scientifiche tra istituzioni similari, le pubblicazioni del Museo vengono distribuite gratuitamente, con la formula dello scambio, ad oltre 600 tra Musei ed Istituti scientifici italiani ed internazionali.
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