Per contribuire alla tutela dell'ambiente attraverso comportamenti consapevoli e responsabili nei confronti delle risorse naturali, il Museo promuove la diffusione della cultura scientifica anche attraverso servizi particolari come:

Consulenze
Il personale scientifico del Museo offre a cittadini, enti ed istituzioni un servizio gratuito di consulenza naturalistica. Le richieste si effettuano previo contatto telefonico, per consentire ai responsabili di fornire tutte le indicazioni di sicurezza e di tutela necessarie.
Privati cittadini, ma anche Aziende Sociosanitarie Locali, forze dell'ordine, Vigili del Fuoco, si rivolgono al Museo per l'identificazione di organismi potenzialmente pericolosi o dannosi.
Vengono inoltre fornite consulenze su vari aspetti naturalistici e ambientali della laguna di Venezia, così come l'assistenza per gli interventi di emergenza che riguardano animali selvatici feriti o spiaggiati (delfini, tartarughe, pipistrelli) o specie protette o sconosciute.

Accesso ai depositi e alle collezioni non esposte
Gli studiosi che desiderano accedere ai depositi e alle collezioni non esposte, possono presentare richiesta motivata ai responsabili scientifici del Museo.

Accesso alle informazioni scientifiche
Sono consultabili, sempre su richiesta, le banche dati informatiche che raccolgono i risultati dalle ricerche in ambiente, dello studio e della schedatura dei materiali delle collezioni zoologiche, dello spoglio di una ricchissima bibliografia scientifica.
I responsabili scientifici del Museo sono inoltre disponibili, su appuntamento, a fornire informazioni e suggerimenti sulle materie di pertinenza.

Accesso alla biblioteca
La biblioteca offre al pubblico un servizio di consultazione dei volumi e delle riviste scientifiche presenti, tra cui una sezione di testi a carattere didattico-divulgativo rivolti anche ai più piccoli .
E' specializzata nel campo delle scienze naturali (scienze della terra, botanica, zoologia, ecologia, ecc.), ma dispone anche di opere relative ad altre discipline (fisica, etnologia, ecc.) e di numerosi testi riguardanti il territorio lagunare.